Можно ли считать материальной точкой поезд движется из Барнаула…

Смотря какую с. О (систему отсчета) мы выберем. Материальная точка — тело, в данных условиях размерами которого можно пренебречь. Если мы сидим в поезде или рассматриваем его как внешние условия — то вряд ли. В остальном — думаю да, когда мы рассматриваем его путь, скорость и пр.