Почему несмотря на притяжение между молекулами есть промежутки?

Потому, что вещество всегда имеет какую-то температуру. Если вещество имеет температуру то его молекулы находяться в постоянном движении. Чем больше скорость движения молекул тем больше растояние между ними при одно и томже давлении. Несмотря на притяжение между молекулами верхний шар всех молекул укрыт електронами (отридцательно заряжеными) так, что при большом сближении начинают действовать силы отталкивания между одинаково заряжеными електронами.